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1.
Rev. argent. microbiol ; 41(3): 151-155, jul.-sep. 2009. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634629

ABSTRACT

Entre junio y diciembre de 2004 se estudiaron 33 aislamientos de Acinetobacter baumannii resistentes a los carbapenemes, aislados de materiales clínicos de 29 pacientes internados en la unidad de cuidados intensivos del Hospital de Clínicas de la Universidad de Buenos Aires. La distribución clonal de esos aislamientos fue la siguiente: clon I (n = 14), clon IV (n = 7), clon III (n = 6), clon VI (n = 3), clon II (n = 2) y clon X (n = 1).Veintiún aislamientos se recuperaron de materiales del tracto respiratorio inferior, 11 de ellos pertenecieron al clon I. Casi todos los aislamientos pertenecientes al clon III (5/6) se recuperaron de materiales no respiratorios, y todos los del clon IV se recuperaron de pacientes que no recibieron imipenem. En los aislamientos pertenecientes a los clones I y III se observó una mayor adherencia a catéteres, principalmente en los asociados con bacteriemias. La mayoría de los aislamientos de los clones I y IV sobrevivieron en materiales inertes durante un período superior a los 5 días. La totalidad de los aislamientos del clon III fueron sensibles a colistina, gentamicina y levofloxacina, mientras que los del clon I y la mayoría de los del clon IV sólo fueron sensibles a colistina y tetraciclinas.


From June to December 2004, thirty-three carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates recovered from twenty nine patients at the intensive care unit in Hospital de Clínicas, Universidad de Buenos Aires, were studied. The isolates were categorized by molecular methods as: clone I (n = 14), clon IV (n = 7), clone III (n = 6), clone VI (n = 3), clone II (n = 2) and clone X (n = 1). Twenty one isolates were recovered from lower respiratory tract samples, 11 of which belonged to clon I. Clone III isolates were mainly recovered from non-respiratory samples (5/6). Clone IV isolates were recovered from patients not receiving previous imipenem therapy. The majority of the isolates belonging to clones I and IV were able to survive on inert materials for more than 5 days, whereas adhesion to catheters was observed in isolates belonging to clones I and III, especially in those related to bacteremia. Clone III isolates showed colistin, gentamicin and levofloxacin susceptibility, whereas clone I isolates and most from clone IV were only susceptible to colistin and tetracyclines.


Subject(s)
Adult , Humans , Acinetobacter Infections/microbiology , Acinetobacter baumannii/isolation & purification , Carbapenems/pharmacology , Cross Infection/microbiology , Disease Outbreaks , Acinetobacter Infections/epidemiology , Acinetobacter baumannii/drug effects , Argentina/epidemiology , Bacterial Adhesion , beta-Lactam Resistance , Catheter-Related Infections/epidemiology , Catheter-Related Infections/microbiology , Clone Cells/drug effects , Cross Infection/epidemiology , Disease Reservoirs , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Equipment Contamination , Hospitals, University , Hospitals, Urban , Intensive Care Units , Pneumonia, Bacterial/epidemiology , Pneumonia, Bacterial/microbiology , Respiration, Artificial/adverse effects , Respiration, Artificial/instrumentation
2.
Rev. argent. microbiol ; 39(2): 99-104, abr.-jun. 2007. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634545

ABSTRACT

Los objetivos del trabajo fueron conocer la prevalencia de tricomonosis en pacientes embarazadas y evaluar la utilidad de diferentes metodologías para su diagnóstico. Se estudiaron prospectivamente 223 mujeres embarazadas. Trichomonas vaginalis se investigó utilizando distintos exámenes microscópicos, cultivo en medio sólido y medio líquido. Se evaluó la sensibilidad y especificidad de la microscopía considerando a los cultivos en ambos medios como método de referencia. La prevalencia del parásito obtenida por cultivo (medio líquido más medio sólido) fue de 4,5% (10/223) siendo la detección por examen en fresco, coloración de May-Grunwald Giemsa, fresco con solución acética formolada (SAF)/azul de metileno y por cultivo en medio sólido y líquido de 1,3%, 1,8%, 1,8% y 4,5% respectivamente. La sensibilidad del examen en fresco fue 30%, para el May-Grunwald Giemsa y el SAF/azul de metileno fue 40%. Utilizando conjuntamente los tres exámenes microscópicos, la sensibilidad se elevó al 50% y la especificidad fue 100% para todos los exámenes microscópicos. El cultivo en medio líquido detectó el 100% de los casos positivos , mientras que el medio sólido sólo el 50%. Por la baja sensibilidad de la microscopía para T. vaginalis, en embarazadas asintomáticas recomendamos la utilización del cultivo en medio líquido durante el embarazo, para instaurar un tratamiento precoz.


The aim of this study was to conduct a survey regarding the prevalence of trichomoniasis in pregnant patients and to evaluate the utility of different diagnostic methods. Two hundred and twenty three vaginal swab specimens from pregnant women were prospectively examined. Trichomonas vaginalis was investigated by various microscopic examinations, solid culture medium and liquid culture medium. The sensitivity and specificity of microscopy were evaluated by considering both culture media as the "gold standards". The prevalence of T. vaginalis obtained by both culture media (liquid plus solid media) was 4.5% (10/223). The prevalence of T. vaginalis obtained by direct smear, May-Grunwald Giemsa staining, sodium acetate-acetic acid-formalin (SAF)/Methylene blue staining-fixing technique, solid medium and liquid medium was 1.3%, 1.8%, 1.8% and 4.5%, respectively. The sensitivity of the direct smear was 30 %, but for the May- Grunwald Giemsa staining and the SAF/Methylene blue staining-fixing technique was 40%. Considering the three microscopic examinations altogether, the sensitivity rose to 50% and the specificity was 100% for all of them. The solid medium detected only 50% of the positive cases; the liquid medium detected 100%. Due to the low sensitivity obtained with microscopy in asymptomatic pregnant patients, we recommend the use of the liquid medium during pregnancy, in order to provide an early treatment.


Subject(s)
Animals , Female , Humans , Pregnancy , Bacteriological Techniques , Pregnancy Complications, Infectious/epidemiology , Trichomonas Vaginitis/epidemiology , Trichomonas vaginalis/isolation & purification , Argentina/epidemiology , Coloring Agents , Culture Media , Eosine Yellowish-(YS) , Methylene Blue , Prevalence , Prospective Studies , Pregnancy Complications, Infectious/diagnosis , Pregnancy Complications, Infectious/microbiology , Sensitivity and Specificity , Staining and Labeling/methods , Trichomonas Vaginitis/diagnosis , Trichomonas Vaginitis/microbiology
3.
Rev. argent. microbiol ; 38(3): 119-124, jul.-sep. 2006. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634522

ABSTRACT

Los objetivos de este trabajo fueron: a) identificar a nivel de especie aislamientos de Proteus siguiendo la combinación de los esquemas de Farmer y O'Hara; b) determinar la utilidad del sistema comercial API 20E y de un esquema reducido de pruebas (agar TSI y agar MIO: movilidad, indol y ornitina), comparar estos procedimientos con la metodología convencional y evaluar su sensibilidad y especificidad, y c) evaluar la utilidad del perfil proteico en la identificación de las distintas especies. Se estudiaron 205 aislamientos de Proteus spp. aislados en el período comprendido entre enero de 1998 y setiembre de 2004, recuperados de distintos materiales clínicos correspondientes a pacientes hospitalizados y ambulatorios atendidos en el Hospital de Clínicas. Los organismos fueron identificados mediante la metodología convencional, por el sistema API 20E y con un esquema reducido de pruebas; 48 de ellos fueron sometidos a un SDS-PAGE. API 20E identificó 79 de 87 aislamientos de P. mirabilis (90,8%), 103/103 del complejo P. vulgaris y 15/15 de P. penneri. Ocho aislamientos identificados como Proteus spp. resultaron ser P. mirabilis, al incluir una prueba adicional (maltosa). En la identificación, el esquema reducido coincidió en un 100% con la metodología convencional. A diferencia del sistema API 20E, el esquema reducido alcanza la correcta identificación de todas las especies en laboratorios de baja complejidad, sin la necesidad de pruebas adicionales. El perfil proteico permitió la correcta diferenciación de las tres especies, independientemente de las diferentes atipias de P. mirabilis.


The objectives were: a) to identify Proteus strains to species level, following Farmer's and O'Hara's conventional biochemical reactions; b) to evaluate the sensitivity and specificity of both the API 20E method and a schema of reduced reactions (TSI and MIO agar: motility, indole and ornithine) comparing them with conventional methodology, and c) to evaluate the utility of SDS-PAGE (total proteins) in order to identify Proteus strains to species level. Two hundred and five Proteus spp. clinical isolates, were collected between January 1998 and September 2004, from inpatients and outpatients at Hospital de Clínicas. Strains were identified by means of conventional methodology, the API 20E method, and a schema of reduced reactions. SDS-PAGE (total proteins) was used in 48 out of the 205 strains. The API 20E method identified 79 out of 87 (90.8%) strains of P. mirabilis, 103 out of 103 P. vulgaris complex, and 15 out of 15 P. penneri. Eight strains of P. mirabilis were identified as Proteus spp., the acid production from maltose being necessary to identify them to species level. The schema of reduced reactions identified 205 out of 205 (100%) strains, that is, this schema of reduced reactions identified all the strains to species level without any additional tests, in marked contrast to the API 20E method. The SDS-PAGE (total proteins) identified the three species of the genus, even if the strains of P. mirabilis showed different biochemical reactions.


Subject(s)
Humans , Proteus/classification , Proteus/isolation & purification , Bacterial Typing Techniques , Sensitivity and Specificity
4.
Rev. argent. microbiol ; 38(1): 9-12, ene.-mar. 2006. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634512

ABSTRACT

La mujer embarazada es más susceptible tanto a la colonización como a la infección vaginal por levaduras. El objetivo de este trabajo fue determinar la prevalencia de levaduras aisladas de exudados vaginales de mujeres embarazadas y evaluar la sensibilidad a los antifúngicos de uso frecuente. Se estudiaron 493 pacientes en el período comprendido desde diciembre de 1998 hasta febrero de 2000. La prevalencia de Candida spp. fue 28% (Candida albicans 90,4%, Candida glabrata 6,3%, Candida parapsilosis 1,1%, Candida kefyr 1,1%, especies no identificadas 1,1%). Se determinó la sensibilidad a fluconazol, ketoconazol, itraconazol y nistatina por el método de difusión en agar Shadomy. Todos los aislamientos de C. albicans, C. kefyr y C. parapsilosis fueron sensibles in vitro a los antifúngicos probados, mientras que 1 de 6 aislamientos de C. glabrata presentó resistencia extendida a todos los azoles, pero sensibilidad a nistatina. En mujeres embarazadas C. albicans fue la levadura más frecuentemente aislada de exudados vaginales y continúa siendo ampliamente sensible a los antifúngicos; sólo en C. glabrata se observó resistencia a los azoles. Se recomienda la identificación de la levadura a nivel de especie particularmente en el caso de falla terapéutica y en infecciones recidivantes o crónicas.


Pregnant women are more susceptible to both vaginal colonization and infection by yeast. Our objectives were to determine the prevalence in pregnant women of yeasts isolated from vaginal exudates and their susceptibility to current antifungal drugs. A total of 493 patients was studied between December 1998 and February 2000. The prevalence of Candida spp. was 28% (Candida albicans 90.4%; Candida glabrata 6.3%; Candida parapsilosis 1.1%, Candida kefyr 1.1%; unidentified species 1.1%). The diffusion test in Shadomy agar was employed to determine the susceptibility to fluconazole, ketoconazole, itraconazole and nistatine. All C. albicans, C. kefyr and C. parapsilosis isolates were susceptible in vitro to the antifungal agents tested, while 1 in 6 C. glabrata isolates showed resistance to azole drugs; all strains were susceptible to nistatine. In pregnant women, C. albicans was the yeast most frequently isolated from vaginal exudates; it continues to be highly susceptible to antifungal drugs. Azole resistance was detected only among C. glabrata isolates. Identification to the species level is recommended, specially in cases of treatment failure and recurrent or chronic infection.


Subject(s)
Adolescent , Adult , Female , Humans , Pregnancy , Candida/isolation & purification , Candidiasis, Vulvovaginal/epidemiology , Pregnancy Complications, Infectious/epidemiology , Antifungal Agents/pharmacology , Argentina/epidemiology , Candida/classification , Candida/drug effects , Candidiasis, Vulvovaginal/microbiology , Drug Resistance, Fungal , Prevalence , Pregnancy Complications, Infectious/microbiology , Species Specificity
5.
Rev. argent. microbiol ; 38(1): 33-37, ene.-mar. 2006. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634515

ABSTRACT

Se estudiaron 91 aislamientos de Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenemes con el objetivo de conocer la prevalencia de metalo-β-lactamasas y evaluar la habilidad del ensayo de inhibición empleando discos de EDTA (1 µmol) en su detección. Se determinó la presencia de carbapenemasas en 10 (11%) de los aislamientos recuperados. La sensibilidad a aztreonam en los aislamientos resistentes a ambos carbapenemes resultó un buen predictor de la presencia de estas enzimas. Dichas carbapenemasas correspondieron a la enzima VIM-2 en tres de ellos y a VIM-11 en otros siete. En todos los casos los genes codificantes de estas enzimas se encontraron localizados en integrones de clase 1 seguidos corriente abajo de genes codificantes de enzimas acetilantes de antibióticos aminoglucosídicos. El ensayo de detección fenotípica de metalo-β-lactamasas empleando discos de EDTA mostró un 100% de especificidad y sensibilidad en la detección de estas enzimas en la población de Pseudomonas aeruginosa analizadas.


The present study was conducted to estimate the prevalence of metallo-β-lactamases in 91 consecutive carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa isolates, recovered from inpatients at Hospital de Clínicas in Buenos Aires. Both, phenotypic and genotypic methods detected the presence of carbapenemases in 10 (11%) isolates, corresponding to VIM-11 in 7/10 and VIM-2 in the others. Codifying genes were all included in class 1 integrons, upstream genes coding for aminoglycoside modifying enzymes. One hundred percent sensitivity and specificity was achieved by the metallo-β-lactamases phenotypic screening method using EDTA (1 µmol) disks in the Pseudomonas aeruginosa isolates included in this study. Sensitivity to aztreonam in carbapenem resistant isolates was suspicious of the presence of these enzymes.


Subject(s)
Humans , Carbapenems/pharmacology , Pseudomonas Infections/microbiology , Pseudomonas aeruginosa/enzymology , beta-Lactam Resistance/genetics , beta-Lactamases/analysis , Argentina/epidemiology , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Genotype , Hospitals, University/statistics & numerical data , Imipenem/pharmacology , Phenotype , Pseudomonas Infections/epidemiology , Pseudomonas aeruginosa/drug effects , Pseudomonas aeruginosa/genetics , Thienamycins/pharmacology , Urban Population , beta-Lactamases/genetics
6.
Rev. argent. microbiol ; 37(4): 203-208, oct.-dic. 2005. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634506

ABSTRACT

Enterobacter spp. es un patógeno intrahospitalario que presenta múltiples mecanismos de resistencia a los antibióticos b-lactámicos. Se caracterizaron fenotípica y genotípicamente las diferentes b-lactamasas presentes en 27 aislamientos consecutivos e ininterrumpidos de Enterobacter spp. (25 Enterobacter cloacae y 2 Enterobacter aerogenes). También se evaluó la habilidad de diferentes métodos fenotípicos para detectar b-lactamasas de espectro extendido (BLEE) en estos microorganismos. En 15/27 aislamientos (63%) se observó resistencia a las cefalosporinas de tercera generación. En 12 de los aislamientos resistentes se detectó un alto nivel de producción de cefalosporinasa cromosómica, siendo 6 de ellos también productores de PER-2. Dicha resistencia en los 3 aislamientos restantes se debió exclusivamente a la presencia de BLEE, PER-2 en 2 de ellos y CTX-M-2 en un caso. Sólo CTX-M-2 se detectó con todas las cefalosporinas probadas en los ensayos de sinergia, utilizando el método de difusión, mientras que cefepima mejoró la detección de PER-2 en 7/8 aislamientos productores de esta BLEE, 4/8 utilizando la prueba de doble disco y 7/8 comparando discos de cefepima con y sin el agregado de ácido clavulánico. El método de dilución empleado solo detectó 1/9 BLEE al comparar las cefalosporinas con y sin el agregado de inhibidor.


Enterobacter spp. are becoming increasingly frequent nosocomial pathogens with multiple resistance mechanism to b-lactam antibiotics. We carried out the phenotypic and genotypic characterization of beta-lactamases in 27 Enterobacter spp. (25 Enterobacter cloacae y 2 Enterobacter aerogenes), as well as the ability of different extended spectrum b-lactamase (ESBL) screening methods. Resistance to third generation cephalosporins was observed in 15/27 (63%) isolates. Twelve resistant isolates produced high level chromosomal encoded AmpC b-lactamase; 6 of them were also producers of PER-2. Resistance to third generation cephalosporins in the remaining 3 isolates was due to the presence of ESBLs, PER-2 in 2 cases, and CTX-M-2 in the other. Only CTX-M-2 production was detected with all tested cephalosporins using difusion synergy tests, while cefepime improved ESBLs detection in 7/8 PER-2 producers, 4/8 in the inhibitor aproximation test and 7/8 with double disk test using cefepime containing disk with and without clavulanic acid. Dilution method, including cephalosporins with and without the inhibitor detected 1/9 ESBLs producers.


Subject(s)
Humans , Cephalosporin Resistance , Cephalosporins/pharmacology , Enterobacter aerogenes/drug effects , Enterobacter cloacae/drug effects , Cephalosporin Resistance/genetics , Cephalosporins/classification , Drug Resistance, Multiple, Bacterial/genetics , Enterobacter aerogenes/enzymology , Enterobacter aerogenes/genetics , Enterobacter cloacae/enzymology , Enterobacter cloacae/genetics , Enterobacteriaceae Infections/microbiology , Genotype , Isoelectric Point , Microbial Sensitivity Tests , Phenotype , beta-Lactamases/genetics
7.
Rev. argent. microbiol ; 37(3): 156-160, jul.-sep. 2005. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634498

ABSTRACT

The aim of this study was to characterize methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates recovered from different infectious sites of hospitalized patients at two university hospitals. Fourteen isolates were analyzed by repetitive sequence based PCR (Rep-PCR), randomly amplified polymorphic DNA assay (RAPD-PCR), and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). We found that a prevalent clone of MRSA, susceptible to rifampin, minocycline, and trimethoprim/sulfamethoxazole (RIF S, MIN S, TMS S) was present in both hospitals in replacement of the multiresistant MRSA South American clone, previously described in these hospitals. The staphylococcal chromosomal cassette (SCCmec) type I element was detected in this new clone.


El objetivo de este trabajo fue la caracterización de aislamientos de Staphylococcus aureus meticilina-resistentes (SAMR), provenientes de diferentes procesos infecciosos de pacientes internados en dos hospitales universitarios. Catorce aislamientos fueron analizados mediante la PCR de secuencias repetitivas (Rep-PCR), la amplificación al azar de ADN polimórfico (RAPD-PCR) y la electroforesis de campo pulsado (PFGE). Encontramos que un clon prevalente de SAMR, sensible a rifampicina, minociclina y trimetoprima-sulfametoxazol (RIF S, MIN S, TMS S) estaba presente en ambos hospitales, reemplazando al clon SAMR y multi-resistente previamente descrito en estos mismos hospitales. En este nuevo clon se detectó el cassette cromosómico estafilocócico SCCmec tipo I.


Subject(s)
Humans , Cross Infection/microbiology , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Hospitals, University/statistics & numerical data , Methicillin Resistance , Staphylococcal Infections/microbiology , Staphylococcus aureus/isolation & purification , Academies and Institutes/statistics & numerical data , Argentina/epidemiology , Bacterial Typing Techniques , Bacterial Proteins/genetics , Cross Infection/epidemiology , Drug Resistance, Multiple, Bacterial/genetics , Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field , Methicillin Resistance/genetics , Methicillin/pharmacology , Minocycline/pharmacology , Polymerase Chain Reaction , Random Amplified Polymorphic DNA Technique , Rifampin/pharmacology , South America/epidemiology , Staphylococcal Infections/epidemiology , Staphylococcus aureus/classification , Staphylococcus aureus/drug effects , Staphylococcus aureus/genetics , Trimethoprim, Sulfamethoxazole Drug Combination/pharmacology , Urban Health
8.
Rev. argent. microbiol ; 37(1): 34-45, ene.-mar. 2005. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634487

ABSTRACT

Los bacilos gram-negativos no fermentadores se encuentran ampliamente distribuidos en el medio ambiente. Además de causar dificultades en la identificación, a menudo presentan una marcada multirresistencia a los antimicrobianos incluyendo aquellos activos frente a Pseudomonas aeruginosa. El objetivo de este trabajo fue evaluar la actividad "in vitro" de diferentes antimicrobianos sobre 177 aislamientos de bacilos gram-negativos no fermentadores (excluidos Pseudomonas aeruginosa y Acinetobacter spp.) provenientes de especimenes clínicos. Las concentraciones inhibitorias mínimas (CIM) se determinaron por el método de dilución en agar Mueller Hinton frente a los siguientes antibacterianos: ampicilina, piperacilina, piperacilina-tazobactama, sulbactama, cefoperazona, cefoperazona-sulbactama, ceftazidima, cefepima, aztreonam, imipenem, meropenem, colistina, gentamicina, amicacina, trimetoprima-sulfametoxazol (TMS), cloranfenicol, eritromicina, rifampicina, norfloxacina, ciprofloxacina y minociclina. Sobre siete aislamientos: Sphingobacterium multivorum (2), Sphingobacterium spiritivorum (1), Empedobacter brevis (1), Weeksella virosa (1), Bergeyella zoohelcum (1) y Oligella urethralis (1) se ensayó la sensibilidad a amoxicilina-ácido clavulánico y ampicilina-sulbactama y no se determinó la actividad de cefoperazona ni de sulbactama. La multirresistencia fue comúnmente observada en los aislamientos de Stenotrophomonas maltophilia, Burkholderia cepacia, Chryseobacterium spp., Myroides spp., Achromobacter xylosoxidans y Ochrobactrum anthropi. En cambio, Pseudomonas stutzeri, Shewanella putrefaciens-algae, Sphingomonas paucimobilis, Pseudomonas oryzihabitans, Bergeyella zoohelcum, Weeksella virosa y Oligella urethralis, fueron ampliamente sensibles a los antibacterianos ensayados. Debido a la gran variabilidad observada en la sensibilidad a los antimicrobianos en las distintas especies, se hace imprescindible realizar la prueba de sensibilidad a los antibacterianos a fin de abordar la elección correcta del mismo. Debido a la marcada multirresistencia de algunas especies, surge la necesidad del desarrollo de nuevos agentes antimicrobianos que posean actividad sobre este grupo de bacterias, así como tambien la búsqueda de combinaciones sinérgicas.


Gram-negative nonfermentative bacilli (NFB) are widely spread in the environment. Besides of difficulties for identification, they often have a marked multiresistance to antimicrobial agents, including those active against Pseudomonas aeruginosa. The objective of this study was to evaluate the ‘in vitro' activity of different antimicrobial agents on 177 gram-negative nonfermentative bacilli isolates (excluding Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp.) isolated from clinical specimens. Minimum inhibitory concentrations (MIC) were determined according to the Mueller Hinton agar dilution method against the following antibacterial agents: ampicillin, piperacillin, piperacillin-tazobactam, sulbactam, cefoperazone, cefoperazone-sulbactam, ceftazidime, cefepime, aztreonam, imipenem, meropenem, colistin, gentamicin, amikacin, trimethoprim-sulfamethoxazole, chloramphenicol, erythromycin, rifampin, norfloxacin, ciprofloxacin and minocycline. Seven isolates: Sphingobacterium multivorum (2 ), Sphingobacterium spiritivorum (1), Empedobacter brevis (1), Weeksella virosa (1), Bergeyella zoohelcum (1) and Oligella urethralis (1), were tested for amoxicillin-clavulanic acid and ampicillin-sulbactam susceptibility, and susceptibility to cefoperazone or sulbactam was not determined. Multiresistance was generally found in Stenotrophomonas maltophilia, Burkholderia cepacia, Chryseobacterium spp., Myroides spp., Achromobacter xylosoxidans, and Ochrobactrum anthropi isolates. On the other hand, Pseudomonas stutzeri, Shewanella putrefaciens-algae, Sphingomonas paucimobilis, and Pseudomonas oryzihabitans, Bergeyella zoohelcum, Weeksella virosa and Oligella urethralis were widely susceptible to the antibacterial agents tested. As a result of the wide variation in antimicrobial susceptibility shown by different species, a test on susceptibility to different antibacterial agents is essential in order to select an adequate therapy. The marked multiresistance evidenced by some species, prompts the need to develop new antimicrobial agents active against this group of bacteria and to search for synergistic combinations.


Subject(s)
Humans , Anti-Bacterial Agents/pharmacology , Gram-Negative Bacteria/drug effects , Drug Resistance , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Gram-Negative Bacteria/isolation & purification , Gram-Negative Bacterial Infections/microbiology , Microbial Sensitivity Tests
9.
Rev. argent. microbiol ; 37(1): 57-66, ene.-mar. 2005. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634489

ABSTRACT

En este documento se elaboraron una serie de recomendaciones para el ensayo, lectura, interpretación e informe de las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos para las enterobacterias aisladas con mayor frecuencia de especímenes clínicos. Se adoptaron como base las recomendaciones del National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) de los EEUU, los de la subcomisión de Antimicrobianos, de la Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica (SADEBAC), división de la Asociación Argentina de Microbiología (AAM) y de un grupo de expertos invitados. En él se indican las resistencias naturales de los diferentes miembros que integran la familia Enterobacteriaceae y se analiza la actividad de las diferentes beta-lactamasas cromosómicas, propias de cada especie, sobre las penicilinas, cefalosporinas y carbapenemes. Se recomiendan los antimicrobianos que se deberían ensayar, ubicados estratégicamente, para detectar los mecanismos de resistencia más frecuentes y cuales se deberían informar de acuerdo a la especie aislada, el sitio de infección y el origen de la cepa (intra o extrahospitalario). Se detallan los métodos de "screening" y de confirmación fenotipíca para detectar beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) que son más adecuados a nuestra realidad. Por último, se mencionan patrones infrecuentes de sensibilidad/resistencia que deberían verificarse y los perfiles de sensibilidad que pueden hallarse en las distintas enterobacterias en relación con los probables mecanismos de resistencia. Se debe resaltar que el contenido de este documento debe ser considerado como recomendaciones realizadas por expertos argentinos basadas en una revisión de la literatura y datos personales.


Taking into account previous recommendations from the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS), the Antimicrobial Committee, Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica (SADEBAC), Asociación Argentina de Microbiología (AAM), and the experience from its members and some invited microbiologists, a consensus was obtained for antimicrobial susceptibility testing and interpretation in most frequent enterobacterial species isolated from clinical samples in our region. This document describes the natural antimicrobial resistance of some Enterobacteriaceae family members, including the resistance profiles due to their own chromosomal encoded beta-lactamases. A list of the antimicrobial agents that should be tested, their position on the agar plates, in order to detect the most frequent antimicrobial resistance mechanisms, and considerations on which antimicrobial agents should be reported regarding to the infection site and patient characteristics are included. Also, a description on appropriate phenotypic screening and confirmatory test for detection of prevalent extended spectrum beta-lactamases in our region are presented. Finally, a summary on frequent antimicrobial susceptibility profiles and their probably associated resistance mechanisms, and some infrequent antimicrobial resistance profiles that deserve confirmation are outlined.


Subject(s)
Humans , Anti-Bacterial Agents/pharmacology , Enterobacteriaceae/drug effects , Microbial Sensitivity Tests , Anti-Bacterial Agents/therapeutic use , Bacterial Proteins/analysis , Drug Resistance , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Enterobacteriaceae Infections/drug therapy , Enterobacteriaceae Infections/microbiology , Enterobacteriaceae/enzymology , Enterobacteriaceae/isolation & purification , Microbial Sensitivity Tests/economics , Microbial Sensitivity Tests/methods , Microbial Sensitivity Tests/standards , Phenotype , Quality Control , beta-Lactamases/analysis
10.
Rev. argent. microbiol ; 36(3): 125-129, jul.-sep. 2004. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634469

ABSTRACT

Las infeccionesproducidas por microorganismos multirresistentes son uno de los mayores problemas en los centros asistenciales. Frecuentemente, sólo las polimixinas muestran actividad “in vitro” frente a aislamientos de bacilos gram-negativos resistentes a los carbapenemes. Sin embargo, el National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) no incluye, actualmente, recomendaciones para la realización de las pruebas de sensibilidad para este grupo de antibióticos. Se determinóla actividad de colistín y la correlación entre las pruebas de difusión y dilución de este antibiótico frente a 186 aislamientos contemporáneos en el Hospital de Clínicas “José de San Martín”, siguiendo las recomendaciones generales del NCCLS. Se evaluaron dos puntos de corte: NCCLS 1981 (resistente £ 8 mm y sensible > 11mm) y R. Jones 2001 (resistente £ 11mm y sensible > 14mm). Utilizando el punto de corte del NCCLS 1981 se cometieron los siguientes errores: 0,5% “minor”; 2,2% “major” y 4,4% “very major”, mientras que con el propuesto por R. Jones 2001: 18,9% “minor”; 3,8% “major” y 0,5% “very major”. En conclusión, dado que el punto de corte utilizado por R. Jones 2001 disminuye el error “very major” pero aumenta el “minor” se recomienda la utilización de la concentración inhibitoria mínima (CIM) para confirmar la sensibilidad a colistín cuando sea usada en el tratamiento de infecciones, sin embargo no se detectó resistencia a colistín con halos de inhibición > a 16 mm.


Infections produced by multidrug resistant organisms are one of the greatest problems in health centers. Often, only polymyxines show good activity “in vitro” against the carbapenem resistant gram-negative strains; but the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) documents do not currently provide interpretative criteria for testing the polymyxines.The antimicrobial activity ofcolistin,and the correlation betweenthe agar dilution test and disk diffusion test were evaluated against 186 gram-negative strains isolated at the Hospital de Clínicas “José de San Martín” of Buenos Aires city. All susceptibility tests were performed according to the NCCLS recommendations. Were evaluated two breakpoints, NCCLS 1981 (£ 8mm and >11mm), and R. Jones 2001 (£ 11 mm and > 14 mm). Discrepancies on interpretative category were found (0.5% minor; 2.2% major and 4.4% very major) with NCCLS 1981, and (18.9% minor; 3.8% majorand 0.5% very major) with R. Jones 2001 criteria. Conclusions. In spite of the fact that the breakpoint used by R. Jones 2001decreases the very major error but increases the minor error, according to our results we recommend the use of MIC methods to assist the therapeutic application of colistin; however resistance to colistin was not detected with zone diameters > 16mm.


Subject(s)
Adult , Child , Humans , Colistin/pharmacology , Gram-Negative Bacteria/drug effects , Microbial Sensitivity Tests/standards , Diffusion , Drug Resistance, Multiple, Bacterial , Endpoint Determination , False Positive Reactions , Gram-Negative Bacterial Infections/microbiology , Microbial Sensitivity Tests/methods , Prospective Studies , Polymyxins/pharmacology
11.
Rev. argent. microbiol ; 36(2): 78-80, abr.-jun. 2004.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1171746

ABSTRACT

We describe four isolates of Ng from men who have sex with men (MSM) patients that were able to grow in the abscense of CO2, as previously was described for N. gonorrhoeae ssp. kochii. These isolates were able to grow aerobically (without any added CO2) at 37 degrees C giving small colonies after 48 hs; two of them isolated from pharynx and urethra of one patient, were also able to grow without the blood supplement in the same conditions. In these unusual isolates the major outer-membrane proteins are of the same molecular weight than Ng. These isolates could be taken for other members of the genus if not confirmed by means of these (or other) methods.

12.
Rev. argent. microbiol ; 36(1): 24-7, Jan.-Mar. 2004.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1171741

ABSTRACT

Bact-Alert automatized system for blood cultures: 5 vs 7 days of incubation. First Argentine multicentre study. Between January and December 2001, we analyzed 80,141 blood cultures by the Bact-Alert system (14,960 FAN aerobics, 3,855 FAN anaerobic, 11,114 standards aerobics, 11,367 standards anaerobic, 12,054 pediatrics and 26,791 FAN pediatrics bottles) and 44.235 series from 27.615 patients at eight hospitals of Buenos Aires city, one of La Plata city and three of the Buenos Aires province. A total of 13,657 blood cultures yielded a positive result. Only 181 of them had been detected as positive between the 5th and 7th day of incubation and only 26 (0.19


) had clinical significance (Staphylococcus aureus 3; coagulase negative staphylococci 2; Enterococcus faecalis 1; Streptococcus pneumoniae 2; Campylobacter spp 1; Escherichia coli 1; Enterobacter cloacae 1; Enterobacteraerogenes 1; Citrobacter freundii 1; Klebsiella pneumoniae 1; Proteus mirabilis 1; Serratia marcescens 4; yeasts 7, including one strain of Cryptococcus neoformans). Of the total of contaminants, 38


were isolated by the anaerobic standard (65


were Propionibacterium spp and 29


by the FAN aerobic (33.3


difphteroids and 28.9


by the pediatric, 9


by aerobic standard and 1.4


by FAN anaerobic bottle. Our results show that the prolonged incubation of blood cultures for more than 5 days using the Bact-Alert system is unnecessary.

13.
Medicina (B.Aires) ; 64(2): 97-102, 2004. tab, ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-444350

ABSTRACT

Legionnaires' disease is a well recognized cause of community acquired pneumonia (CAP) all around the world. In Latin America its incidence remains unknown. This study analyzed a cohort of 9 patients with CAP due to Legionella pneumophila observed from 1997 to 2001, in the Hospital de Clínicas José de San Martin, University of Buenos Aires. Clinical history included recent illnesses, work exposure, physical exam, prior antibiotic use and severity of illness criteria. None of the 9 patients had a history of recent travels, and 4 of them required admission in intensive care unit (ICU). Seven patients had a cigarette smoking history, four of them also had COPD, and one patient had a non-Hodgkin lymphoma. This study confirms the low specificity of clinical and general laboratory criteria to predict this etiology. Legionella isolation is difficult, and serological testing allows retrospective diagnosis but takes several weeks, while urinary antigen test gives a bed-side diagnosis. When Legionella appears in isolated cases, as happens in Argentina, it should be necessary to have a high index of suspicion to successfully arrive at an etiological diagnosis. Legionella pneumophila is a pathogen causing CAP in our area. A surveillance should be established preferably focused on selected populations including severe CAP, immunocompromised hosts and patients with chronic obstructive pulmonary disease.


La enfermedad de los legionarios es una causa de neumonía adquirida en la comunidad (NAC)reconocida en todo el mundo. En Latinoamérica su incidencia es desconocida. En este estudiose analizó a 9 pacientes con NAC por Legionella pneumophila atendidos entre 1997 y 2001 en el Hospital deClínicas José de San Martín de la Universidad de Buenos Aires. Se registraron datos de antecedentes, enfermedad actual, contactos, exposición laboral, examen físico, pruebas de laboratorio y uso previo de antibióticos, y se tomó en cuenta la presencia de criterios de gravedad. Nueve pacientes presentaron diagnóstico de NAC por Legionella, ninguno refirió antecedentes de viajes recientes; cuatro de ellos debieron ser internados en unidades de cuidado intensivo. Siete pacientes tenían antecedentes de tabaquismo, 4 tenían EPOC y un paciente linfoma no-Hodgkin. Nuestra casuística corrobora la baja especificidad de la clínica y estudios complementarios para predecir esta etiología. El aislamiento de Legionella es dificultoso, la seroconversión permite eldiagnóstico retrospectivo y requiere plazos prolongados y el antígeno urinario aporta un diagnóstico inmediato.Cuando la legionelosis aparece en casos aislados, como ocurriría en Argentina, si no se piensa en esta etiologíano se llegará al diagnóstico. Legionella pneumophila es un patógeno de NAC en nuestro medio, debe buscarsemejor, particularmente en pacientes graves, inmunodeprimidos y en fumadores con enfermedad pulmonarobstructiva crónica (EPOC).


Subject(s)
Aged , Female , Humans , Male , Middle Aged , Pulmonary Disease, Chronic Obstructive/complications , Legionnaires' Disease/complications , Legionella pneumophila , Pneumonia, Bacterial/microbiology , Argentina , Pulmonary Disease, Chronic Obstructive/diagnosis , Community-Acquired Infections/microbiology , Pneumonia, Bacterial/diagnosis , Retrospective Studies , Risk Factors , Tobacco Use Disorder/adverse effects
14.
Rev. argent. microbiol ; 35(1): 29-40, ene.-mar. 2003.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-356646

ABSTRACT

El antibiograma por difusión en agar con discos se encuentra ampliamente difundido en nuestro medio y se basa primariamente en las recomendaciones del National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). En este documento se elaboraron una serie de recomendaciones para el ensayo, lectura, interpretación e informe de las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos en cocos gram-positivos, adaptadas a la realidad argentina. En esta primera etapa se redactaron las consideraciones generales para la realización de la prueba por difusión, los controles de calidad internos para todos los microorganismos y una actualización sobre las pruebas de sensibilidad en cocos gram-positivos. Se debe resaltar que el contenido de este documento debe ser considerado como recomendaciones realizadas por expertos argentinos y que son el resultado de reuniones de consenso organizadas por la Subcomisión de Antimicrobianos de la Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica, división de la Asociación Argentina de Microbiología. Se formó un equipo de trabajo integrado por expertos en antimicrobianos y a partir de una propuesta inicial, basada en una revisión de la literatura se fueron elaborando diversos documentos de trabajo que fueron mejorados después de ser debatidos por los miembros del grupo de trabajo hasta llegar al documento final. El criterio general fue elaborar recomendaciones acordes a las necesidades de nuestro país que puedan utilizarse en la práctica diaria con el objeto de colaborar en la adecuada elección del tratamiento antibiótico según la especie bacteriana aislada y la localización de la infección.


Subject(s)
Argentina , Enterococcus , Gram-Positive Cocci , Microbial Sensitivity Tests , Staphylococcus , Streptococcus
15.
Rev. argent. microbiol ; 35(3): 133-7, 2003 Jul-Sep.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1171725

ABSTRACT

The ability of the API 20 NE method (6.0 version, bio-Mérieux, Marcy L’Etoile, France) to identify 188 strains of gram negative nonfermentative bacilli (NFB) was evaluated (Fenazinic pigment producing Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp. were excluded). These were isolated from patients treated at the Hospital de Clínicas José de San Martín of the University of Buenos Aires during the period 1996-2001. Strains were identified according to the Schreckenberger P testing method. Out of 188 NFB strains, 175 (93.09


) were correctly identified by the API 20 NE method at the genus and species level (IC95 = 88.47-96.27) while 61 (32.45


) required additional testing for correct identification. Thirteen strains (6.91


; IC95 3.73-11.53) could not be correctly identified and none of them were classified as [quot ]non identified[quot ]. The API 20 NE method is a practical, easy to handle, fast and useful system for the identification of NFB since conventional manual methods take longer and require many biochemical, enzymatic and physiological tests which are sometimes not available depending on the size and capability of the laboratory. Although it is easy to handle, the API 20 NE identification system must be interpreted by an expert microbiologist who must compare the results obtained by this system with the information provided by the distinctive cultures and mobility patterns of these organisms.

16.
Rev. argent. microbiol ; 35(4): 183-7, 2003 Oct-Dec.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1171737

ABSTRACT

Streptococcus agalactiae--group B streptococci (GBS)--is a main cause of severe neonatal infections with a high mortality rate. The detection of pregnant GBS carriers (5-35


) allows intrapartum administration of antibiotic prophylaxis to these women and prevents perinatal infection. We studied the prevalence of GBS in 259 patients between 28 and 37 weeks gestation from April 2000 to March 2002. The anorectum (AR) and vaginal introitus swabs (VI) were cultured in selective Todd-Hewitt broth containing colistin (10 micrograms/ml) and nalidixic acid (15 micrograms/ml) while vaginal swabs (VFS) were cultured following conventional methods. A total of 47 strains of EGB were isolated from 259 patients (18.15


). The prevalence in different samples were: 5.40


in AR and 17.76


in VI + AR (reference method). The isolates were tested against penicillin, ceftriaxone, erythromycin, clindamycin, vancomycin, gentamicin and streptomycin to determine the minimum inhibitory concentration. The resistance phenotypes of erythromycin-resistant GBS were determined by the double-disk test. All strains were susceptible to penicillin, ceftriaxone and vancomycin, only one strain was erythromycin and clindamycin resistant by IMLSB mechanism. None of the isolated strains had a high resistant level to aminoglycosides. The sensitivity of cultures increased when selective broths were used as the primary detection method.

17.
Rev. argent. microbiol ; 34(4): 230-4, 2002 Oct-Dec.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1171706

ABSTRACT

Eikenella corrodens is a gram-negative bacillus that colonizes as normal flora of the mouth, the upper respiratory tract and the gastrointestinal tract. The aim of this study was to determine the susceptibility patterns against fourteen antibiotics of 25 E. corrodens strains isolated at our hospital. MICs were determined by the agar dilution technique using M³eller-Hinton agar with sheep blood (5


v/v) to penicillin, ampicillin, ampicillin-sulbactam, cephalotin, cefoxitin, ceftiaxone, colistin, gentamicin, amikacin, erythromycin, rifampin, ciprofloxacin and clindamycin. The most active antibiotics were ciprofloxacin and ceftriaxone (MIC90 = 0.008 and 0.125 microgram/ml, respectively), whereas eritromycin, gentamicin and amikacin showed less activity. Only one strain was beta lactamase positive, and it was inhibited by sulbactam. Erithromycin, gentamicin and amikacin had poor activity (MIC90 = 16.8 and 64 micrograms/ml, respectively), whereas all the strains were uniformly resistant to clindamycin (MIC > or = 32 micrograms/ml). We suggest about the need of periodical surveys of E. corrodens susceptibility patterns, since strains have been found with decreased susceptibility against antibiotics which are currently being used for the treatment of infectious diseases.

20.
Infectol. microbiol. clin ; 5(3): 55-8, ago. 1993. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-151465

ABSTRACT

Fueron estudiadas 21 cepas de Corynebacterium urealyticum aisladas de distintos pacientes: 19 (90,5 por ciento) de infecciones urinarias, 1 de un cálculo renal y la restante de un absceso retroperitoneal. Sobre 15 cepas tomadas al azar, se determinó la CIM de 10 antibióticos: vancomicina, ciprofloxacina, rifampicina, penicilina, cefalotina, ceftriaxona, imipenem, amikacina, gentamicina y cotrimoxazol. En 18 (85,7 ciento por ciento) pacientes los cultivos fueron monomicrobianos y en 3 (14,3 por ciento), asociados a otras bacterias. La totalidad de las cepas fueron catalasa y ureasa positivas. Ninguna redujo los nitratos ni fermentó los hidratos de carbono. Las 15 cepas sobre las que se determinó la CIM fueron totalmente sensibles a vancomicina y parcialmente sensibles a ciprofloxacina y rifampicina. La producción de ureasa y la no fermentación de la glucosa, asociadas a la multirresistencia, conforman elementos de inestimable valor para la identificación presuntiva del C. urealyticum


Subject(s)
Humans , Corynebacterium/isolation & purification , Culture Media , Corynebacterium Infections/diagnosis , Corynebacterium Infections/drug therapy , Corynebacterium/classification , Corynebacterium/drug effects , Culture Media/standards , Microbial Sensitivity Tests/standards , Microbial Sensitivity Tests/statistics & numerical data , Urinary Tract Infections/diagnosis , Urinary Tract Infections/etiology
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